mirror of
https://github.com/galaxyproject/galaxy.git
synced 2026-09-24 16:30:27 +08:00
merging from central
This commit is contained in:
Greg Von Kuster
@@ -47,6 +47,7 @@ WebError = 0.8a
|
||||
WebHelpers = 0.2
|
||||
WebOb = 0.8.5
|
||||
wsgiref = 0.1.2
|
||||
Babel = 0.9.4
|
||||
|
||||
; extra version information
|
||||
[tags]
|
||||
@@ -92,3 +93,4 @@ WebError = http://pypi.python.org/packages/source/W/WebError/WebError-0.8a.tar.g
|
||||
WebHelpers = http://pypi.python.org/packages/source/W/WebHelpers/WebHelpers-0.2.tar.gz
|
||||
WebOb = http://pypi.python.org/packages/source/W/WebOb/WebOb-0.8.5.tar.gz
|
||||
wsgiref = http://pypi.python.org/packages/source/w/wsgiref/wsgiref-0.1.2.zip
|
||||
Babel = http://ftp.edgewall.com/pub/babel/Babel-0.9.4.zip
|
||||
|
||||
@@ -183,5 +183,3 @@ def configure_logging( config ):
|
||||
# Hook everything up
|
||||
handler.setFormatter( formatter )
|
||||
root.addHandler( handler )
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -24,6 +24,9 @@ pkg_resources.require( "Mako" )
|
||||
import mako.template
|
||||
import mako.lookup
|
||||
|
||||
pkg_resources.require( "Babel" )
|
||||
from babel.support import Translations
|
||||
|
||||
pkg_resources.require( "SQLAlchemy >= 0.4" )
|
||||
from sqlalchemy import and_
|
||||
|
||||
@@ -134,6 +137,7 @@ class UniverseWebTransaction( base.DefaultWebTransaction ):
|
||||
self.__history = NOT_SET
|
||||
self.__galaxy_session = NOT_SET
|
||||
base.DefaultWebTransaction.__init__( self, environ )
|
||||
self.setup_i18n()
|
||||
self.sa_session.clear()
|
||||
self.debug = asbool( self.app.config.get( 'debug', False ) )
|
||||
# Flag indicating whether we are in workflow building mode (means
|
||||
@@ -144,6 +148,16 @@ class UniverseWebTransaction( base.DefaultWebTransaction ):
|
||||
self.__ensure_valid_session( session_cookie )
|
||||
if self.app.config.require_login:
|
||||
self.__ensure_logged_in_user( environ )
|
||||
def setup_i18n( self ):
|
||||
if 'HTTP_ACCEPT_LANGUAGE' in self.environ:
|
||||
# locales looks something like: ['en', 'en-us;q=0.7', 'ja;q=0.3']
|
||||
locales = self.environ['HTTP_ACCEPT_LANGUAGE'].split( ',' )
|
||||
locales = [ l.split( ';' )[0] for l in locales ]
|
||||
else:
|
||||
# Default to English
|
||||
locales = 'en'
|
||||
t = Translations.load( dirname='locale', locales=locales, domain='ginga' )
|
||||
self.template_context.update ( dict( _=t.gettext, n_=t.gettext, N_=t.ngettext ) )
|
||||
@property
|
||||
def sa_session( self ):
|
||||
"""
|
||||
|
||||
Binary file not shown.
@@ -0,0 +1,299 @@
|
||||
# SOME DESCRIPTIVE TITLE.
|
||||
# Copyright (C) 2009 THE PACKAGE'S COPYRIGHT HOLDER
|
||||
# This file is distributed under the same license as the PACKAGE package.
|
||||
# FIRST AUTHOR <EMAIL@ADDRESS>, 2009.
|
||||
#
|
||||
msgid ""
|
||||
msgstr ""
|
||||
"Project-Id-Version: PACKAGE VERSION\n"
|
||||
"Report-Msgid-Bugs-To: \n"
|
||||
"POT-Creation-Date: 2008-09-21 18:33+0900\n"
|
||||
"PO-Revision-Date: 2009-03-17 03:55-0400\n"
|
||||
"Last-Translator: FULL NAME <EMAIL@ADDRESS>\n"
|
||||
"Language-Team: en <LL@li.org>\n"
|
||||
"Plural-Forms: nplurals=2; plural=(n != 1)\n"
|
||||
"MIME-Version: 1.0\n"
|
||||
"Content-Type: text/plain; charset=utf-8\n"
|
||||
"Content-Transfer-Encoding: 8bit\n"
|
||||
"Generated-By: Babel 0.9.4\n"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:17
|
||||
msgid " a new empty history"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:22 templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid " current history"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:14
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid " current history (stored as \"%s\")"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:20
|
||||
msgid " from the current history"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:15
|
||||
msgid " previously stored histories"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:8
|
||||
msgid " to store or switch histories."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:9 templates/user/index.mako:11
|
||||
msgid "Account settings"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:39
|
||||
msgid "Account: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:16
|
||||
msgid "Admin password: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:41
|
||||
msgid "An error occurred running this job: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid "Are you sure you want to delete the current history?"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:16
|
||||
msgid "Change your password"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:20
|
||||
msgid "Construct workflow"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:17
|
||||
msgid "Create"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:24
|
||||
msgid "Create new account"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:9
|
||||
msgid "Current Name"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid "Delete"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:23
|
||||
msgid "Email of User to share with:"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:76
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "Error: unknown dataset state \"%s\"."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:2 templates/admin_main.mako:7
|
||||
msgid "Galaxy Administration"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:12
|
||||
msgid "Galaxy History"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:11
|
||||
msgid "Galaxy Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:34
|
||||
msgid "History"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:8
|
||||
msgid "History Name:"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:4
|
||||
msgid "History Options"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:57 templates/root/masthead.mako:25
|
||||
msgid "Info: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:38
|
||||
msgid "Job is currently running"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:36
|
||||
msgid "Job is waiting to run"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:15
|
||||
msgid "List"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:36
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "Logged in as %s: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:23
|
||||
msgid "Login"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:18
|
||||
msgid "Logout"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:100
|
||||
msgid "Manage"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:9
|
||||
msgid "New Name"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:45
|
||||
msgid "No data: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:8
|
||||
msgid "Number of Datasets:"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:32
|
||||
msgid "Options"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:27
|
||||
msgid "Reload"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:18
|
||||
msgid "Reload tool: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:14
|
||||
msgid "Rename"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:2 templates/history/rename.mako:5
|
||||
msgid "Rename History"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:22
|
||||
msgid "Share"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:5
|
||||
msgid "Share Histories"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:8
|
||||
msgid "Share Link"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:2
|
||||
msgid "Share histories"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:14
|
||||
msgid "This history contains no data."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:5
|
||||
msgid "Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:17
|
||||
msgid "Update your email address"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:95
|
||||
msgid "Workflow"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:14
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "You are currently logged in as %s."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:21
|
||||
msgid "You are currently not logged in."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:223
|
||||
msgid "You are currently viewing a deleted history!"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:8
|
||||
msgid "You must be "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:252
|
||||
msgid "Your history is empty. Click 'Get Data' on the left pane to start"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:28
|
||||
msgid "blog"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:20
|
||||
msgid "copy link to share"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:39
|
||||
msgid "create"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:50
|
||||
msgid "database: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:49
|
||||
msgid "format: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:8
|
||||
msgid "logged in"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:40
|
||||
msgid "login"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:37
|
||||
msgid "logout"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:36
|
||||
msgid "manage"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:218
|
||||
msgid "refresh"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:25
|
||||
msgid "report bugs"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:42
|
||||
msgid "report this error"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:27
|
||||
msgid "screencasts"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:26
|
||||
msgid "wiki"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:100
|
||||
msgid "workflows"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
Binary file not shown.
@@ -0,0 +1,85 @@
|
||||
# English translations for PROJECT.
|
||||
# Copyright (C) 2009 ORGANIZATION
|
||||
# This file is distributed under the same license as the PROJECT project.
|
||||
# FIRST AUTHOR <EMAIL@ADDRESS>, 2009.
|
||||
#
|
||||
msgid ""
|
||||
msgstr ""
|
||||
"Project-Id-Version: PROJECT VERSION\n"
|
||||
"Report-Msgid-Bugs-To: EMAIL@ADDRESS\n"
|
||||
"POT-Creation-Date: 2009-03-17 04:07-0400\n"
|
||||
"PO-Revision-Date: 2009-03-17 04:07-0400\n"
|
||||
"Last-Translator: FULL NAME <EMAIL@ADDRESS>\n"
|
||||
"Language-Team: en <LL@li.org>\n"
|
||||
"Plural-Forms: nplurals=2; plural=(n != 1)\n"
|
||||
"MIME-Version: 1.0\n"
|
||||
"Content-Type: text/plain; charset=utf-8\n"
|
||||
"Content-Transfer-Encoding: 8bit\n"
|
||||
"Generated-By: Babel 0.9.4\n"
|
||||
|
||||
msgid "Get Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Get ENCODE Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "ENCODE Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Lift-Over"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Text Manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Filter and Sort"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Join, Subtract and Group"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Convert Formats"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Extract Features"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Sequences"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Alignments"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Get Genomic Scores"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Operate on Genomic Intervals"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Statistics"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Graph/Display Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Regional Variation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Evolution: HyPhy"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Taxonomy manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Solexa tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "FASTA manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Short Read QC and Manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Short Read Mapping"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
@@ -0,0 +1,296 @@
|
||||
# SOME DESCRIPTIVE TITLE.
|
||||
# Copyright (C) YEAR THE PACKAGE'S COPYRIGHT HOLDER
|
||||
# This file is distributed under the same license as the PACKAGE package.
|
||||
# FIRST AUTHOR <EMAIL@ADDRESS>, YEAR.
|
||||
#
|
||||
msgid ""
|
||||
msgstr ""
|
||||
"Project-Id-Version: PACKAGE VERSION\n"
|
||||
"Report-Msgid-Bugs-To: \n"
|
||||
"POT-Creation-Date: 2008-09-21 18:33+0900\n"
|
||||
"PO-Revision-Date: YEAR-MO-DA HO:MI+ZONE\n"
|
||||
"Last-Translator: FULL NAME <EMAIL@ADDRESS>\n"
|
||||
"Language-Team: LANGUAGE <LL@li.org>\n"
|
||||
"MIME-Version: 1.0\n"
|
||||
"Content-Type: text/plain; charset=utf-8\n"
|
||||
"Content-Transfer-Encoding: 8bit\n"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:17
|
||||
msgid " a new empty history"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:22 templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid " current history"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:14
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid " current history (stored as \"%s\")"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:20
|
||||
msgid " from the current history"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:15
|
||||
msgid " previously stored histories"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:8
|
||||
msgid " to store or switch histories."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:9 templates/user/index.mako:11
|
||||
msgid "Account settings"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:39
|
||||
msgid "Account: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:16
|
||||
msgid "Admin password: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:41
|
||||
msgid "An error occurred running this job: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid "Are you sure you want to delete the current history?"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:16
|
||||
msgid "Change your password"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:20
|
||||
msgid "Construct workflow"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:17
|
||||
msgid "Create"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:24
|
||||
msgid "Create new account"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:9
|
||||
msgid "Current Name"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid "Delete"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:23
|
||||
msgid "Email of User to share with:"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:76
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "Error: unknown dataset state \"%s\"."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:2 templates/admin_main.mako:7
|
||||
msgid "Galaxy Administration"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:12
|
||||
msgid "Galaxy History"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:11
|
||||
msgid "Galaxy Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:34
|
||||
msgid "History"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:8
|
||||
msgid "History Name:"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:4
|
||||
msgid "History Options"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:57 templates/root/masthead.mako:25
|
||||
msgid "Info: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:38
|
||||
msgid "Job is currently running"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:36
|
||||
msgid "Job is waiting to run"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:15
|
||||
msgid "List"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:36
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "Logged in as %s: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:23
|
||||
msgid "Login"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:18
|
||||
msgid "Logout"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:100
|
||||
msgid "Manage"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:9
|
||||
msgid "New Name"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:45
|
||||
msgid "No data: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:8
|
||||
msgid "Number of Datasets:"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:32
|
||||
msgid "Options"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:27
|
||||
msgid "Reload"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:18
|
||||
msgid "Reload tool: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:14
|
||||
msgid "Rename"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:2 templates/history/rename.mako:5
|
||||
msgid "Rename History"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:22
|
||||
msgid "Share"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:5
|
||||
msgid "Share Histories"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:8
|
||||
msgid "Share Link"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:2
|
||||
msgid "Share histories"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:14
|
||||
msgid "This history contains no data."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:5
|
||||
msgid "Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:17
|
||||
msgid "Update your email address"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:95
|
||||
msgid "Workflow"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:14
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "You are currently logged in as %s."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:21
|
||||
msgid "You are currently not logged in."
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:223
|
||||
msgid "You are currently viewing a deleted history!"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:8
|
||||
msgid "You must be "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:252
|
||||
msgid "Your history is empty. Click 'Get Data' on the left pane to start"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:28
|
||||
msgid "blog"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:20
|
||||
msgid "copy link to share"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:39
|
||||
msgid "create"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:50
|
||||
msgid "database: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:49
|
||||
msgid "format: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:8
|
||||
msgid "logged in"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:40
|
||||
msgid "login"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:37
|
||||
msgid "logout"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:36
|
||||
msgid "manage"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:218
|
||||
msgid "refresh"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:25
|
||||
msgid "report bugs"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:42
|
||||
msgid "report this error"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:27
|
||||
msgid "screencasts"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:26
|
||||
msgid "wiki"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:100
|
||||
msgid "workflows"
|
||||
msgstr ""
|
||||
Binary file not shown.
@@ -0,0 +1,518 @@
|
||||
# SOME DESCRIPTIVE TITLE.
|
||||
# Copyright (C) YEAR THE PACKAGE'S COPYRIGHT HOLDER
|
||||
# This file is distributed under the same license as the PACKAGE package.
|
||||
# FIRST AUTHOR <EMAIL@ADDRESS>, YEAR.
|
||||
#
|
||||
msgid ""
|
||||
msgstr ""
|
||||
"Project-Id-Version: ginga 1.0\n"
|
||||
"Report-Msgid-Bugs-To: \n"
|
||||
"POT-Creation-Date: 2008-09-15 13:58+0900\n"
|
||||
"PO-Revision-Date: 2008-09-21 19:13+0900\n"
|
||||
"Last-Translator: Mitsuteru Nakao <mn@kazusa.or.jp>\n"
|
||||
"Language-Team: Japanese\n"
|
||||
"MIME-Version: 1.0\n"
|
||||
"Content-Type: text/plain; charset=UTF-8\n"
|
||||
"Content-Transfer-Encoding: 8bit\n"
|
||||
"Plural-Forms: nplurals=1; plural=0;\n"
|
||||
|
||||
#:
|
||||
msgid "iso-8859-1"
|
||||
msgstr "utf-8"
|
||||
|
||||
#:
|
||||
msgid "lang=\"en\""
|
||||
msgstr "lang=\"ja\""
|
||||
|
||||
|
||||
#: templates/base_panels.mako:5
|
||||
msgid "Galaxy"
|
||||
msgstr "Galaxy"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid "Are you sure you want to delete the current history?"
|
||||
msgstr "現在のヒストリーを消すことに同意しますか？"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:38
|
||||
msgid "collapse all"
|
||||
msgstr "すべてをおりたたむ"
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:5
|
||||
msgid "Tools"
|
||||
msgstr "ツール"
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
#: tools/**.xml
|
||||
msgid "Get Data"
|
||||
msgstr "データ取得"
|
||||
|
||||
msgid "Get ENCODE Data"
|
||||
msgstr "ENCODEデータ取得"
|
||||
|
||||
msgid "ENCODE Tools"
|
||||
msgstr "ENCODEツール"
|
||||
|
||||
msgid "Lift-Over"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Text Manipulation"
|
||||
msgstr "テキスト操作"
|
||||
|
||||
msgid "Filter and Sort"
|
||||
msgstr "フィルターとソート"
|
||||
|
||||
msgid "Join, Subtract and Group"
|
||||
msgstr "結合、差分、集合演算"
|
||||
|
||||
msgid "Convert Formats"
|
||||
msgstr "フォーマット変換"
|
||||
|
||||
msgid "Extract Features"
|
||||
msgstr "Features抽出"
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Sequences"
|
||||
msgstr "配列の取得"
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Alignments"
|
||||
msgstr "アラインメントの取得"
|
||||
|
||||
msgid "Get Genomic Scores"
|
||||
msgstr "ゲノムスコア取得"
|
||||
|
||||
msgid "Operate on Genomic Intervals"
|
||||
msgstr "ゲノム間隔での操作"
|
||||
|
||||
msgid "Statistics"
|
||||
msgstr "統計量"
|
||||
|
||||
msgid "Graph/Display Data"
|
||||
msgstr "グラフ／データ表示"
|
||||
|
||||
msgid "Regional Variation"
|
||||
msgstr "領域的多型"
|
||||
|
||||
msgid "Evolution: HyPhy"
|
||||
msgstr "進化: HyPhy"
|
||||
|
||||
msgid "Taxonomy manipulation"
|
||||
msgstr "系統学的操作"
|
||||
|
||||
msgid "Solexa tools"
|
||||
msgstr "Solexaツールス"
|
||||
|
||||
msgid "FASTA manipulation"
|
||||
msgstr "FASTA操作"
|
||||
|
||||
msgid "Short Read QC and Manipulation"
|
||||
msgstr "Short Read QCと操作"
|
||||
|
||||
msgid "Short Read Mapping"
|
||||
msgstr "Short Readマッピング"
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:3 templates/admin_main.mako:8
|
||||
msgid "Galaxy Administration"
|
||||
msgstr "Galaxy 管理"
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:17
|
||||
msgid "Admin password: "
|
||||
msgstr "管理者パスワード: "
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:19
|
||||
msgid "Reload tool: "
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
#: templates/admin_main.mako:35
|
||||
msgid "Reload"
|
||||
msgstr "再読込する"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:2
|
||||
msgid "History Item Attributes"
|
||||
msgstr "ヒストリーアイテム変数"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:19
|
||||
msgid "Edit Attributes"
|
||||
msgstr "変数を編集する"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:64
|
||||
msgid ""
|
||||
"This will inspect the dataset and attempt to correct the above column values "
|
||||
"if they are not accurate."
|
||||
msgstr "これはデータセットを調査して上記のカラムの値を修正することを試みます。"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:68
|
||||
msgid ""
|
||||
"Required metadata values are missing. Some of these values may not be "
|
||||
"editable by the user. Selecting \"Auto-detect\" will attempt to fix these "
|
||||
"values."
|
||||
msgstr "必要なメタデータの値が不明です。それらのいくつかの値はユーザによって編集可能にはなっていません。「自動判定」を選択するとそれらの値をただしくできるかもしれません。"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:78
|
||||
msgid "Convert to new format"
|
||||
msgstr "新しいフォーマットに変換する"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:84
|
||||
msgid "Convert to"
|
||||
msgstr "変換する"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:95
|
||||
msgid ""
|
||||
"This will create a new dataset with the contents of this dataset converted "
|
||||
"to a new format."
|
||||
msgstr "新しいフォーマットに変換したデータセットを新規作成します。"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:111
|
||||
msgid "Change data type"
|
||||
msgstr "データタイプを変更する"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:117
|
||||
msgid "New Type"
|
||||
msgstr "新しいタイプ"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:124
|
||||
msgid ""
|
||||
"This will change the datatype of the existing dataset but <i>not</i> modify "
|
||||
"its contents. Use this if Galaxy has incorrectly guessed the type of your "
|
||||
"dataset."
|
||||
msgstr "これは既存のデータセットのデータタイプを変更します。しかしデータセットの中身は変更しません。データセットのタイプの誤判定があったときに使用します。"
|
||||
|
||||
#: templates/dataset/edit_attributes.mako:137
|
||||
msgid "Copy History Item"
|
||||
msgstr "ヒストリーアイテムをコピーする"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:3
|
||||
msgid "Your saved histories"
|
||||
msgstr "保存したヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:19
|
||||
msgid "Stored Histories"
|
||||
msgstr "格納してあるヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:21 templates/root/history.mako:239
|
||||
msgid "hide deleted"
|
||||
msgstr "削除したヒストリーを隠す"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:23
|
||||
msgid "show deleted"
|
||||
msgstr "削除したヒストリーを表示する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:27
|
||||
msgid "Name"
|
||||
msgstr "名前"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:27
|
||||
msgid "Size"
|
||||
msgstr "サイズ"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:27
|
||||
msgid "Last modified"
|
||||
msgstr "最終更新日"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:27
|
||||
msgid "Actions"
|
||||
msgstr "操作"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:45
|
||||
msgid "rename"
|
||||
msgstr "名称変更する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:46
|
||||
msgid "switch to"
|
||||
msgstr "変更する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:47
|
||||
msgid "delete"
|
||||
msgstr "削除する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:49
|
||||
msgid "undelete"
|
||||
msgstr "削除から戻す"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:55
|
||||
msgid "Action"
|
||||
msgstr "操作"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:56 templates/history/options.mako:21
|
||||
msgid "Share"
|
||||
msgstr "共有"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:56 templates/history/options.mako:15
|
||||
msgid "Rename"
|
||||
msgstr "名称変更する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:56 templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid "Delete"
|
||||
msgstr "削除する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:58
|
||||
msgid "Undelete"
|
||||
msgstr "削除から戻す"
|
||||
|
||||
#: templates/history/list.mako:65
|
||||
msgid "You have no stored histories"
|
||||
msgstr "保管してあるヒストリーはありません"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:5
|
||||
msgid "History Options"
|
||||
msgstr "ヒストリーオプション"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:9
|
||||
msgid "You must be "
|
||||
msgstr "あなたは"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:9
|
||||
msgid "logged in"
|
||||
msgstr "ログイン"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:9
|
||||
msgid " to store or switch histories."
|
||||
msgstr "しないとヒストリーの保管や変更ができません。"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:15
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid " current history (stored as \"%s\")"
|
||||
msgstr " 現在のヒストリー（\"%s\" として保管されています）"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:16
|
||||
msgid "List"
|
||||
msgstr "リストする"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:16
|
||||
msgid " previously stored histories"
|
||||
msgstr " 以前に保管したヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:18
|
||||
msgid "Create"
|
||||
msgstr "作成する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:18
|
||||
msgid " a new empty history"
|
||||
msgstr " 新規ヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:20
|
||||
msgid "Construct workflow"
|
||||
msgstr "ワークフローを構築する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:20
|
||||
msgid " from the current history"
|
||||
msgstr " 現在のヒストリーから"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:21 templates/history/options.mako:24
|
||||
msgid " current history"
|
||||
msgstr " 現在のヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:23
|
||||
msgid "Show deleted"
|
||||
msgstr "削除したヒストリーを表示する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/options.mako:23
|
||||
msgid " datasets in history"
|
||||
msgstr " ヒストリーのデータセット"
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:3 templates/history/rename.mako:6
|
||||
msgid "Rename History"
|
||||
msgstr "ヒストリーの名称変更をする"
|
||||
|
||||
|
||||
msgid "Rename Histories"
|
||||
msgstr "名称変更する"
|
||||
|
||||
msgid "Perform Action"
|
||||
msgstr "操作を実行する"
|
||||
|
||||
msgid "Submit"
|
||||
msgstr "登録する"
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:10
|
||||
msgid "Current Name"
|
||||
msgstr "現在の名称"
|
||||
|
||||
#: templates/history/rename.mako:10
|
||||
msgid "New Name"
|
||||
msgstr "新しい名称"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:3
|
||||
msgid "Share histories"
|
||||
msgstr "ヒストリーを共有する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:6
|
||||
msgid "Share Histories"
|
||||
msgstr "ヒストリーを共有する"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:9
|
||||
msgid "History Name:"
|
||||
msgstr "ヒストリー名"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:9
|
||||
msgid "Number of Datasets:"
|
||||
msgstr "データセット数"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:9
|
||||
msgid "Share Link"
|
||||
msgstr "共有リンク"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:15
|
||||
msgid "This history contains no data."
|
||||
msgstr "このヒストリーにはデータがありません。"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:21
|
||||
msgid "copy link to share"
|
||||
msgstr "共有リンクをコピーする"
|
||||
|
||||
#: templates/history/share.mako:24
|
||||
msgid "Email of User to share with:"
|
||||
msgstr "共有したいユーザのEメール:"
|
||||
#msgstr "つぎのヒストリーを共有するユーザのEメールアドレス:"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:7
|
||||
msgid "Galaxy History"
|
||||
msgstr "Galaxy ヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:237
|
||||
msgid "refresh"
|
||||
msgstr "リフレッシュ"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:245
|
||||
msgid "You are currently viewing a deleted history!"
|
||||
msgstr "消去したヒストリーをみています。"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history.mako:289
|
||||
msgid "Your history is empty. Click 'Get Data' on the left pane to start"
|
||||
msgstr "ヒストリーは空です。解析をはじめるには、左パネルの 'データ取得' をクリック"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:41
|
||||
msgid "Job is waiting to run"
|
||||
msgstr "ジョブは実行待ちです"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:43
|
||||
msgid "Job is currently running"
|
||||
msgstr "ジョブは実行中です"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:46
|
||||
msgid "An error occurred running this job: "
|
||||
msgstr "このジョブの実行中に発生したエラー: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:47
|
||||
msgid "report this error"
|
||||
msgstr "このエラーを報告する"
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:54
|
||||
msgid "No data: "
|
||||
msgstr "データ無し: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:58
|
||||
msgid "format: "
|
||||
msgstr "フォーマット: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:59
|
||||
msgid "database: "
|
||||
msgstr "データベース: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:66 templates/root/masthead.mako:20
|
||||
msgid "Info: "
|
||||
msgstr "情報: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/history_common.mako:85
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "Error: unknown dataset state \"%s\"."
|
||||
msgstr "エラー: 不明なデータ状態 \"%s\"。"
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:32
|
||||
msgid "Options"
|
||||
msgstr "オプション"
|
||||
|
||||
#: templates/root/index.mako:34
|
||||
msgid "History"
|
||||
msgstr "ヒストリー"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:20
|
||||
msgid "report bugs"
|
||||
msgstr "バグを報告する"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:21
|
||||
msgid "wiki"
|
||||
msgstr "wiki"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:22
|
||||
msgid "screencasts"
|
||||
msgstr "スクリーンキャスト"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:23
|
||||
msgid "blog"
|
||||
msgstr "ブログ"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:31
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "Logged in as %s: "
|
||||
msgstr "%s としてログイン中: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:31
|
||||
msgid "manage"
|
||||
msgstr "管理"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:32
|
||||
msgid "logout"
|
||||
msgstr "ログアウト"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:34
|
||||
msgid "Account: "
|
||||
msgstr "アカウント: "
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:34
|
||||
msgid "create"
|
||||
msgstr "作成"
|
||||
|
||||
#: templates/root/masthead.mako:35
|
||||
msgid "login"
|
||||
msgstr "ログイン"
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:52
|
||||
msgid "Galaxy Tools"
|
||||
msgstr "Galaxy ツール群"
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:129
|
||||
msgid "Workflow"
|
||||
msgstr "ワークフロー"
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:134
|
||||
msgid "Manage"
|
||||
msgstr "管理"
|
||||
|
||||
#: templates/root/tool_menu.mako:134
|
||||
msgid "workflows"
|
||||
msgstr "ワークフロー"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:2 templates/user/index.mako:4
|
||||
msgid "Account settings"
|
||||
msgstr "アカウント設定"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:7
|
||||
#, python-format
|
||||
msgid "You are currently logged in as %s."
|
||||
msgstr "%s としてログイン中。"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:9
|
||||
msgid "Change your password"
|
||||
msgstr "パスワード変更"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:10
|
||||
msgid "Update your email address"
|
||||
msgstr "メールアドレス変更"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:11
|
||||
msgid "Logout"
|
||||
msgstr "ログアウト"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:16
|
||||
msgid "Login"
|
||||
msgstr "ログイン"
|
||||
|
||||
#: templates/user/index.mako:17
|
||||
msgid "Create new account"
|
||||
msgstr "新規アカウントを作成する"
|
||||
Binary file not shown.
@@ -0,0 +1,85 @@
|
||||
# Japanese translations for PROJECT.
|
||||
# Copyright (C) 2009 ORGANIZATION
|
||||
# This file is distributed under the same license as the PROJECT project.
|
||||
# FIRST AUTHOR <EMAIL@ADDRESS>, 2009.
|
||||
#
|
||||
msgid ""
|
||||
msgstr ""
|
||||
"Project-Id-Version: PROJECT VERSION\n"
|
||||
"Report-Msgid-Bugs-To: EMAIL@ADDRESS\n"
|
||||
"POT-Creation-Date: 2009-03-17 04:06-0400\n"
|
||||
"PO-Revision-Date: 2009-03-17 04:06-0400\n"
|
||||
"Last-Translator: FULL NAME <EMAIL@ADDRESS>\n"
|
||||
"Language-Team: ja <LL@li.org>\n"
|
||||
"Plural-Forms: nplurals=1; plural=0\n"
|
||||
"MIME-Version: 1.0\n"
|
||||
"Content-Type: text/plain; charset=utf-8\n"
|
||||
"Content-Transfer-Encoding: 8bit\n"
|
||||
"Generated-By: Babel 0.9.4\n"
|
||||
|
||||
msgid "Get Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Get ENCODE Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "ENCODE Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Lift-Over"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Text Manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Filter and Sort"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Join, Subtract and Group"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Convert Formats"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Extract Features"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Sequences"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Alignments"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Get Genomic Scores"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Operate on Genomic Intervals"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Statistics"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Graph/Display Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Regional Variation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Evolution: HyPhy"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Taxonomy manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Solexa tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "FASTA manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Short Read QC and Manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Short Read Mapping"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
@@ -0,0 +1,66 @@
|
||||
#: tools/**.xml
|
||||
msgid "Get Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Get ENCODE Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "ENCODE Tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Lift-Over"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Text Manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Filter and Sort"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Join, Subtract and Group"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Convert Formats"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Extract Features"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Sequences"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Fetch Alignments"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Get Genomic Scores"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Operate on Genomic Intervals"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Statistics"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Graph/Display Data"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Regional Variation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Evolution: HyPhy"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Taxonomy manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Solexa tools"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "FASTA manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Short Read QC and Manipulation"
|
||||
msgstr ""
|
||||
|
||||
msgid "Short Read Mapping"
|
||||
msgstr ""
|
||||
@@ -7,6 +7,7 @@ top level directly.
|
||||
|
||||
import os, sys
|
||||
|
||||
sys.setdefaultencoding( 'utf_8' )
|
||||
assert sys.version_info[:2] >= ( 2, 4 )
|
||||
|
||||
new_path = [ os.path.join( os.getcwd(), "lib" ) ]
|
||||
|
||||
+7
-6
@@ -1,12 +1,13 @@
|
||||
<% _=n_ %>
|
||||
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
|
||||
<html>
|
||||
|
||||
<head>
|
||||
<title>${self.title()}</title>
|
||||
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1" />
|
||||
${self.stylesheets()}
|
||||
${self.javascripts()}
|
||||
</head>
|
||||
<head>
|
||||
<title>a ${self.title()}</title>
|
||||
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=${_('iso-8859-1')}" />
|
||||
${self.stylesheets()}
|
||||
${self.javascripts()}
|
||||
</head>
|
||||
|
||||
<body>
|
||||
${next.body()}
|
||||
|
||||
@@ -199,14 +199,13 @@
|
||||
</%def>
|
||||
|
||||
## Document
|
||||
<html lang="en">
|
||||
|
||||
<html>
|
||||
${self.init()}
|
||||
|
||||
<head>
|
||||
<title>${self.title()}</title>
|
||||
${self.javascripts()}
|
||||
${self.stylesheets()}
|
||||
<title>${self.title()}</title>
|
||||
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=${_('iso-8859-1')}" />
|
||||
${self.javascripts()}
|
||||
${self.stylesheets()}
|
||||
</head>
|
||||
|
||||
<body scroll="no">
|
||||
|
||||
@@ -1,8 +1,7 @@
|
||||
<%inherit file="/base.mako"/>
|
||||
<%namespace file="/message.mako" import="render_msg" />
|
||||
|
||||
<%def name="title()">Edit Dataset Attributes</%def>
|
||||
|
||||
<%def name="title()">${_('Edit Dataset Attributes')}</%def>
|
||||
|
||||
<%def name="datatype( dataset, datatypes )">
|
||||
<select name="datatype">
|
||||
@@ -18,118 +17,95 @@
|
||||
</%def>
|
||||
|
||||
<div class="toolForm">
|
||||
<div class="toolFormTitle">Edit Attributes</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="edit_attributes" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<div class="toolFormTitle">${_('Edit Attributes')}</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="edit_attributes" action="${h.url_for( action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}">
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
Name:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="text" name="name" value="${data.name}" size="40">
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
Info:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="text" name="info" value="${data.info}" size="40">
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
%for name, spec in data.metadata.spec.items():
|
||||
%if spec.visible:
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
${spec.desc}:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
${data.metadata.get_html_by_name( name )}
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
%endif
|
||||
%endfor
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<input type="submit" name="save" value="${_('Save')}">
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
<form name="auto_detect" action="${h.url_for( action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}">
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="submit" name="detect" value="${_('Auto-detect')}">
|
||||
</div>
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
${_('This will inspect the dataset and attempt to correct the above column values if they are not accurate.')}
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
%if data.missing_meta():
|
||||
<div class="errormessagesmall">${_('Required metadata values are missing. Some of these values may not be editable by the user. Selecting "Auto-detect" will attempt to fix these values.')}</div>
|
||||
%endif
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
<p />
|
||||
|
||||
<% converters = data.get_converter_types() %>
|
||||
%if len( converters ) > 0:
|
||||
<div class="toolForm">
|
||||
<div class="toolFormTitle">${_('Convert to new format')}</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="convert_data" action="${h.url_for( action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}">
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
Name:
|
||||
${_('Convert to')}:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="text" name="name" value="${data.name}" size="40"/>
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
Info:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="text" name="info" value="${data.info}" size="40"/>
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
%for name, spec in data.metadata.spec.items():
|
||||
%if spec.visible:
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
${spec.desc}:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
${data.metadata.get_html_by_name( name )}
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
%endif
|
||||
%endfor
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<input type="submit" name="save" value="Save"/>
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
<form name="auto_detect" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="submit" name="detect" value="Auto-detect"/>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
This will inspect the dataset and attempt to correct the above column values if they are not accurate.
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
%if data.missing_meta():
|
||||
<div class="errormessagesmall">Required metadata values are missing. Some of these values may not be changeable by the user. Selecting "Auto-detect" will attempt to fix these values.</div>
|
||||
%endif
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
<p />
|
||||
<% converters = data.get_converter_types() %>
|
||||
%if len( converters ) > 0:
|
||||
<div class="toolForm">
|
||||
<div class="toolFormTitle">Convert to new format</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="convert_data" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
Convert to:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<select name="target_type">
|
||||
%for key, value in converters.items():
|
||||
<option value="${key}">${value.name[8:]}</option>
|
||||
%endfor
|
||||
</select>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
This will create a new dataset with the contents of this dataset converted to a new format.
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<input type="submit" name="convert_data" value="Convert"/>
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
<p />
|
||||
%endif
|
||||
<div class="toolForm">
|
||||
<div class="toolFormTitle">Change data type</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="change_datatype" action="${h.url_for( controller='root', action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}"/>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
New Type:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
${datatype( data, datatypes )}
|
||||
<select name="target_type">
|
||||
%for key, value in converters.items():
|
||||
<option value="${key}">${value.name[8:]}</option>
|
||||
%endfor
|
||||
</select>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
This will change the datatype of the existing dataset
|
||||
but <i>not</i> modify its contents. Use this if Galaxy
|
||||
has incorrectly guessed the type of your dataset.
|
||||
${_('This will create a new dataset with the contents of this dataset converted to a new format.')}
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<input type="submit" name="change" value="Save"/>
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
<p />
|
||||
|
||||
</div>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<input type="submit" name="convert_data" value="${_('Convert')}">
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
<p />
|
||||
%endif
|
||||
%if trans.app.security_agent.allow_action( trans.user, data.permitted_actions.DATASET_MANAGE_PERMISSIONS, dataset = data ):
|
||||
<%namespace file="/dataset/security_common.mako" import="render_permission_form" />
|
||||
${render_permission_form( data.dataset, data.name, h.url_for( controller='root', action='edit', id=data.id ), trans.user.all_roles() )}
|
||||
@@ -154,7 +130,26 @@
|
||||
%else:
|
||||
<p>This dataset is accessible by everyone (it is public).</p>
|
||||
%endif
|
||||
<div class="toolForm">
|
||||
<div class="toolFormTitle">${_('Change data type')}</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="change_datatype" action="${h.url_for( action='edit' )}" method="post">
|
||||
<input type="hidden" name="id" value="${data.id}">
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<label>
|
||||
${_('New Type')}:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
${datatype( data, datatypes )}
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
%endif
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
${_('This will change the datatype of the existing dataset but <i>not</i> modify its contents. Use this if Galaxy has incorrectly guessed the type of your dataset.')}
|
||||
</div>
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
</div>
|
||||
<div class="form-row">
|
||||
<input type="submit" name="change" value="${_('Save')}">
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
</div>
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
+28
-27
@@ -1,3 +1,4 @@
|
||||
<% _=n_ %>
|
||||
<%inherit file="/base.mako"/>
|
||||
<%def name="title()">${form.title}</%def>
|
||||
|
||||
@@ -15,33 +16,33 @@ $(function(){
|
||||
%endif
|
||||
|
||||
<div class="form">
|
||||
<div class="form-title">${form.title}</div>
|
||||
<div class="form-body">
|
||||
<form name="${form.name}" action="${form.action}" method="post" >
|
||||
%for input in form.inputs:
|
||||
<%
|
||||
cls = "form-row"
|
||||
if input.error:
|
||||
cls += " form-row-error"
|
||||
%>
|
||||
<div class="${cls}">
|
||||
%if input.use_label:
|
||||
<label>
|
||||
${input.label}:
|
||||
</label>
|
||||
%endif
|
||||
<div class="form-row-input">
|
||||
<input type="${input.type}" name="${input.name}" value="${input.value}" size="40">
|
||||
</div>
|
||||
%if input.error:
|
||||
<div class="form-row-error-message">${input.error}</div>
|
||||
%endif
|
||||
|
||||
%if input.help:
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
${input.help}
|
||||
</div>
|
||||
%endif
|
||||
<div class="toolFormTitle">${form.title}</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form name="${form.name}" action="${form.action}" method="post" >
|
||||
%for input in form.inputs:
|
||||
<%
|
||||
cls = "form-row"
|
||||
if input.error:
|
||||
cls += " form-row-error"
|
||||
%>
|
||||
<div class="${cls}">
|
||||
<label>
|
||||
${_(input.label)}:
|
||||
</label>
|
||||
<div style="float: left; width: 250px; margin-right: 10px;">
|
||||
<input type="${input.type}" name="${input.name}" value="${input.value}" size="40">
|
||||
</div>
|
||||
%if input.error:
|
||||
<div style="float: left; color: red; font-weight: bold; padding-top: 1px; padding-bottom: 3px;">
|
||||
<div style="width: 300px;"><img style="vertical-align: middle;" src="${h.url_for('/static/style/error_small.png')}"> <span style="vertical-align: middle;">${input.error}</span></div>
|
||||
</div>
|
||||
%endif
|
||||
|
||||
%if input.help:
|
||||
<div class="toolParamHelp" style="clear: both;">
|
||||
${input.help}
|
||||
</div>
|
||||
%endif
|
||||
|
||||
<div style="clear: both"></div>
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -1,3 +1,4 @@
|
||||
<% _=n_ %>
|
||||
<%inherit file="/base.mako"/>
|
||||
<%def name="title()">Your saved histories</%def>
|
||||
|
||||
@@ -62,7 +63,7 @@
|
||||
</%def>
|
||||
|
||||
|
||||
<h2>Stored Histories</h2>
|
||||
<h2>${_('Stored Histories')}</h2>
|
||||
|
||||
<ul class="manage-table-actions">
|
||||
<li>
|
||||
@@ -199,3 +200,4 @@
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -24,3 +24,4 @@
|
||||
<li><a href="${h.url_for( controller='history', action='list', operation="delete", id=history.id )}" confirm="Are you sure you want to delete the current history?">Delete</a> current history</div>
|
||||
</ul>
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -1,16 +1,17 @@
|
||||
<% _=n_ %>
|
||||
<%inherit file="/base.mako"/>
|
||||
<%def name="title()">Rename History</%def>
|
||||
<%def name="title()">${_('Rename History')}</%def>
|
||||
|
||||
<div class="toolForm">
|
||||
<div class="toolFormTitle">Rename History</div>
|
||||
<div class="toolFormTitle">${_('Rename History')}</div>
|
||||
<div class="toolFormBody">
|
||||
<form action="${h.url_for( controller='history', action='rename' )}" method="post" >
|
||||
<table>
|
||||
<tr><th>Current Name</th><th>New Name</th></tr>
|
||||
<tr><th>${_('Current Name')}</th><th>${_('New Name')}</th></tr>
|
||||
%for history in histories:
|
||||
<tr><td>${history.name}<input type="hidden" name="id" value="${history.id}"></td><td><input type="text" name="name" value="${history.name}" size="40"></td></tr>
|
||||
%endfor
|
||||
<tr><td colspan="2"><input type="submit" name="history_rename_btn" value="Rename Histories"></td></tr>
|
||||
<tr><td colspan="2"><input type="submit" name="history_rename_btn" value="${_('Rename Histories')}"></td></tr>
|
||||
</table>
|
||||
</form>
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
@@ -115,3 +115,4 @@
|
||||
</div>
|
||||
</form>
|
||||
%endif
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -51,3 +51,4 @@
|
||||
<div class="${messagetype}message">${msg}</div>
|
||||
<br/>
|
||||
</%def>
|
||||
|
||||
|
||||
+51
-50
@@ -1,16 +1,17 @@
|
||||
<% _=n_ %>
|
||||
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
|
||||
|
||||
<html>
|
||||
|
||||
<head>
|
||||
<title>Galaxy History</title>
|
||||
<title>${_('Galaxy History')}</title>
|
||||
|
||||
## This is now only necessary for tests
|
||||
%if bool( [ data for data in history.active_datasets if data.state in ['running', 'queued', '', None ] ] ):
|
||||
<!-- running: do not change this comment, used by TwillTestCase.wait -->
|
||||
%endif
|
||||
|
||||
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1" />
|
||||
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=${_('iso-8859-1')}" />
|
||||
<meta http-equiv="Pragma" content="no-cache">
|
||||
<link href="${h.url_for('/static/style/base.css')}" rel="stylesheet" type="text/css" />
|
||||
<link href="${h.url_for('/static/style/history.css')}" rel="stylesheet" type="text/css" />
|
||||
@@ -29,7 +30,7 @@
|
||||
initShowHide();
|
||||
setupHistoryItem( q("div.historyItemWrapper") );
|
||||
// Collapse all
|
||||
q("#top-links").append( "| " ).append( q("<a href='#'>collapse all</a>").click( function() {
|
||||
q("#top-links").append( "| " ).append( q("<a href='#'>${_('collapse all')}</a>").click( function() {
|
||||
q( "div.historyItemBody:visible" ).each( function() {
|
||||
if ( q.browser.mozilla )
|
||||
{
|
||||
@@ -39,7 +40,7 @@
|
||||
})
|
||||
var state = new CookieSet( "galaxy.history.expand_state" );
|
||||
state.removeAll().save();
|
||||
return false;
|
||||
return false;
|
||||
}));
|
||||
$("#history-rename").click( function() {
|
||||
var old_name = $("#history-name").text()
|
||||
@@ -72,13 +73,13 @@
|
||||
return false;
|
||||
})
|
||||
})
|
||||
// Functionized so AJAX'd datasets can call them
|
||||
//' Functionized so AJAX'd datasets can call them
|
||||
// Get shown/hidden state from cookie
|
||||
function initShowHide() {
|
||||
q( "div.historyItemBody" ).hide();
|
||||
// Load saved state and show as neccesary
|
||||
var state = new CookieSet( "galaxy.history.expand_state" );
|
||||
for ( id in state.store ) { q( "#" + id ).children( "div.historyItemBody" ).show(); }
|
||||
for ( id in state.store ) { q( "#" + id ).children( "div.historyItemBody" ).show(); }
|
||||
// If Mozilla, hide scrollbars in hidden items since they cause animation bugs
|
||||
if ( q.browser.mozilla ) {
|
||||
q( "div.historyItemBody" ).each( function() {
|
||||
@@ -110,51 +111,51 @@
|
||||
state.add( id ); state.save();
|
||||
delete state;
|
||||
}
|
||||
return false;
|
||||
return false;
|
||||
});
|
||||
// Delete link
|
||||
q(this).find( "a.historyItemDelete" ).each( function() {
|
||||
var data_id = this.id.split( "-" )[1];
|
||||
q(this).click( function() {
|
||||
q( '#progress-' + data_id ).show();
|
||||
q.ajax({
|
||||
url: "${h.url_for( action='delete_async', id='XXX' )}".replace( 'XXX', data_id ),
|
||||
error: function() { alert( "Delete failed" ) },
|
||||
success: function() {
|
||||
%if show_deleted:
|
||||
var to_update = {};
|
||||
to_update[data_id] = "none";
|
||||
updater( to_update );
|
||||
%else:
|
||||
q( "#historyItem-" + data_id ).fadeOut( "fast", function() {
|
||||
q( "div#historyItemContainer-" + data_id ).remove();
|
||||
if ( q( "div.historyItemContainer" ).length < 1 ) {
|
||||
q ( "div#emptyHistoryMessage" ).show();
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
%endif
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
return false;
|
||||
});
|
||||
});
|
||||
var data_id = this.id.split( "-" )[1];
|
||||
q(this).click( function() {
|
||||
q( '#progress-' + data_id ).show();
|
||||
q.ajax({
|
||||
url: "${h.url_for( action='delete_async', id='XXX' )}".replace( 'XXX', data_id ),
|
||||
error: function() { alert( "Delete failed" ) },
|
||||
success: function() {
|
||||
%if show_deleted:
|
||||
var to_update = {};
|
||||
to_update[data_id] = "none";
|
||||
updater( to_update );
|
||||
%else:
|
||||
q( "#historyItem-" + data_id ).fadeOut( "fast", function() {
|
||||
q( "div#historyItemContainer-" + data_id ).remove();
|
||||
if ( q( "div.historyItemContainer" ).length < 1 ) {
|
||||
q ( "div#emptyHistoryMessage" ).show();
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
%endif
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
return false;
|
||||
});
|
||||
});
|
||||
// Undelete link
|
||||
q(this).find( "a.historyItemUndelete" ).each( function() {
|
||||
var data_id = this.id.split( "-" )[1];
|
||||
q(this).click( function() {
|
||||
q( '#progress-' + data_id ).show();
|
||||
q.ajax({
|
||||
url: "${h.url_for( controller='dataset', action='undelete_async', id='XXX' )}".replace( 'XXX', data_id ),
|
||||
error: function() { alert( "Undelete failed" ) },
|
||||
success: function() {
|
||||
var to_update = {};
|
||||
to_update[data_id] = "none";
|
||||
updater( to_update );
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
return false;
|
||||
});
|
||||
});
|
||||
var data_id = this.id.split( "-" )[1];
|
||||
q(this).click( function() {
|
||||
q( '#progress-' + data_id ).show();
|
||||
q.ajax({
|
||||
url: "${h.url_for( controller='dataset', action='undelete_async', id='XXX' )}".replace( 'XXX', data_id ),
|
||||
error: function() { alert( "Undelete failed" ) },
|
||||
success: function() {
|
||||
var to_update = {};
|
||||
to_update[data_id] = "none";
|
||||
updater( to_update );
|
||||
}
|
||||
});
|
||||
return false;
|
||||
});
|
||||
});
|
||||
});
|
||||
};
|
||||
// Looks for changes in dataset state using an async request. Keeps
|
||||
@@ -237,9 +238,9 @@
|
||||
<body class="historyPage">
|
||||
|
||||
<div id="top-links" class="historyLinks">
|
||||
<a href="${h.url_for('history', show_deleted=show_deleted)}">refresh</a>
|
||||
<a href="${h.url_for('history', show_deleted=show_deleted)}">${_('refresh')}</a>
|
||||
%if show_deleted:
|
||||
| <a href="${h.url_for('history', show_deleted=False)}">hide deleted</a>
|
||||
| <a href="${h.url_for('history', show_deleted=False)}">${_('hide deleted')}</a>
|
||||
%endif
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
@@ -250,7 +251,7 @@
|
||||
|
||||
%if history.deleted:
|
||||
<div class="warningmessagesmall">
|
||||
You are currently viewing a deleted history!
|
||||
${_('You are currently viewing a deleted history!')}
|
||||
</div>
|
||||
<p></p>
|
||||
%endif
|
||||
@@ -289,7 +290,7 @@
|
||||
</script>
|
||||
<div class="infomessagesmall" id="emptyHistoryMessage" style="display:none;">
|
||||
%endif
|
||||
Your history is empty. Click 'Get Data' on the left pane to start
|
||||
${_("Your history is empty. Click 'Get Data' on the left pane to start")}
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
</body>
|
||||
|
||||
@@ -2,7 +2,7 @@
|
||||
<history>
|
||||
%for data in history.active_datasets:
|
||||
<data id="${data.id}" hid="${data.hid}" name="${data.name}" state="${data.state}" dbkey="${data.dbkey}">
|
||||
${data.blurb}
|
||||
${_(data.blurb)}
|
||||
</data>
|
||||
%endfor
|
||||
</history>
|
||||
|
||||
@@ -25,6 +25,8 @@
|
||||
</div>
|
||||
%if data_state == 'running':
|
||||
<div><img src="${h.url_for('/static/style/data_running.gif')}" border="0" align="middle"></div>
|
||||
%elif data_state == 'upload':
|
||||
<div><img src="${h.url_for('/static/style/data_upload.gif')}" border="0" align="middle"></div>
|
||||
%elif data_state != 'ok':
|
||||
<div><img src="${h.url_for( "/static/style/data_%s.png" % data_state )}" border="0" align="middle"></div>
|
||||
%endif
|
||||
@@ -42,6 +44,8 @@
|
||||
<div id="info${data.id}" class="historyItemBody">
|
||||
%if not trans.app.security_agent.allow_action( trans.user, data.permitted_actions.DATASET_ACCESS, dataset = data.dataset ):
|
||||
<div>You do not have permission to view this dataset.</div>
|
||||
%elif data_state == "upload":
|
||||
<div>Dataset is uploading</div>
|
||||
%elif data_state == "queued":
|
||||
<div>Job is waiting to run</div>
|
||||
%elif data_state == "running":
|
||||
@@ -115,3 +119,4 @@
|
||||
</div>
|
||||
|
||||
</%def>
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -57,3 +57,4 @@
|
||||
<iframe name="galaxy_history" width="100%" height="100%" frameborder="0" style="position: absolute; margin: 0; border: 0 none; height: 100%;" src="${h.url_for( controller='root', action='history' )}"></iframe>
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</div>
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</%def>
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@@ -79,3 +79,4 @@
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</body>
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</html>
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@@ -119,3 +119,4 @@
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</body>
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</html>
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@@ -18,3 +18,4 @@
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<li><a href="${h.url_for( action='create' )}">Register</a></li>
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</ul>
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%endif
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@@ -1,3 +1,4 @@
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<% _ = t.gettext %>
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<!-- -->
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<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
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@@ -49,7 +50,7 @@ th {
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</table>
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%if disabled:
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<hr>
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<div><input type="checkbox" name="dataset_ids" value="${data.hid}" checked="true" />Treat as input dataset</div>
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<div><input type="checkbox" name="dataset_ids" value="${data.hid}" checked="true" />${_('Treat as input dataset')}</div>
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%endif
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</div>
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</%def>
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@@ -67,17 +68,17 @@ into a workflow will be shown in gray.</p>
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<form method="post" action="${h.url_for()}">
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<div class='form-row'>
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<label>Workflow name</label>
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<label>${_('Workflow name')}</label>
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<input name="workflow_name" type="text" value="Workflow constructed from history '${history.name}'" size="60"/>
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</div>
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<p><input type="submit" value="Create Workflow" /></p>
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<p><input type="submit" value="${_('Create Workflow')}" /></p>
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<table border="0" cellspacing="0">
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<tr>
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<th style="width: 47.5%">Tool</th>
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<th style="width: 47.5%">${_('Tool')}</th>
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<th style="width: 5%"></th>
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<th style="width: 47.5%">History items created</th>
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||||
<th style="width: 47.5%">${_('History items created')}</th>
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</tr>
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%for job, datasets in jobs.iteritems():
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@@ -25,6 +25,7 @@ log = logging.getLogger( __name__ )
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default_galaxy_test_host = "localhost"
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default_galaxy_test_port = "9999"
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default_galaxy_locales = 'en'
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galaxy_test_file_dir = "test-data"
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server = None
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app = None
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@@ -35,6 +36,8 @@ def setup():
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galaxy_test_host = os.environ.get( 'GALAXY_TEST_HOST', default_galaxy_test_host )
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||||
galaxy_test_port = os.environ.get( 'GALAXY_TEST_PORT', default_galaxy_test_port )
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||||
if 'HTTP_ACCEPT_LANGUAGE' not in os.environ:
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os.environ['HTTP_ACCEPT_LANGUAGE'] = default_galaxy_locales
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||||
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||||
start_server = 'GALAXY_TEST_EXTERNAL' not in os.environ
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||||
if start_server:
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