John Chilton 7c13c03dd6 Fix Galaxy tool/workflow staging and refactor for reuse in Planemo.

2020-08-01 10:34:46 -04:00

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exports

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library

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rules

…

users

…

1.axt

…

1.bam

…

1.bed

…

1.bed.spaces

…

1.bedgraph

…

1.bigbed

…

1.bigwig

…

1.csv

…

1.customtrack

…

1.fasta

…

1.fasta.gz

…

1.fastq

…

1.fastqsanger

…

1.fastqsanger.bz2

…

1.fastqsanger.gz

…

1.fastqsolexa

…

1.interval

…

1.lav

…

1.pileup

…

1.RData

…

1.sam

…

1.sam.gz

…

1.scf

…

1.sff

…

1.tabular

…

1.tiff

…

1.txt

…

1.wig

…

2.bed

…

2.fasta

…

2.tabular

…

2gen.fastq

…

3.bam

…

3.bed

…

3.maf

…

3unsorted.bam

…

4.bed

…

4.bed.bz2

…

4.bed.gz

…

4.bed.zip

…

5_Ig-like.gff

…

5.bed

…

5.gff

…

5.gff3

…

6.bed

…

7.bed

…

8.bed

…

9.bed

…

11.tabular

…

454Score.pdf

…

454Score.png

…

a.tab

…

a.txt

…

asian_chars_1.txt

…

bad.html.gz

…

bam_from_sam.bam

…

bam_native_from_sam.bam

…

bcf_index_metadata_test.bcf

…

bcf_index_metadata_test.txt

…

biom1_metadata_test.txt

…

cat_wrapper_out1.bed

…

composite_output_expected_log

…

example-bag.zip

…

filter1_in3.sam

…

filter1_in5.tab

…

filter1_in6.bed

…

filter1_inbad.bed

…

filter1_test1.bed

…

filter1_test2.bed

…

filter1_test3.sam

…

filter1_test4.bed

…

filter1_test5.tab

…

filter1_test6.bed

…

filter_labels_1.txt

…

GRCm38mm10_chr5_34761740-34912521.fa

…

html_file.txt

…

input_taxonomy.biom1

…

joiner_header_in1.tab

…

joiner_header_in2.tab

…

joiner_out1.bed

…

joiner_out2.bed

…

joiner_out3.bed

…

joiner_out4.bed

…

joiner_out5.tab

…

joiner_out6.tab

…

joiner_out7.tab

…

matrix.cool

…

MTBLS6.zip

…

neostore.zip

…

new_element_sort_order.txt

…

new_labels_1.txt

…

new_labels_2.txt

…

new_labels_bad_1.txt

…

new_labels_bad_2.txt

…

new_tags_1.txt

…

phiX.fasta

…

qname_sorted.bam

…

qualscores.qual454

…

qualscores.qualsolid

…

random-file

…

rgenetics.bed

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rgenetics.bim

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rgenetics.fam

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rgenetics.map

…

rgenetics.ped

…

safe_relative_symlink.tar

…

safetar_with_symlink.tar

…

sam_with_header.sam

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selenium-test-notebook.ipynb

…

shrimp_cs_test1.csfasta

…

simple_line_alternative.txt

…

simple_line_no_newline.txt

Fix Galaxy tool/workflow staging and refactor for reuse in Planemo.

2020-08-01 10:34:46 -04:00

simple_line_x2.txt

…

simple_line_x3.txt

…

simple_line_x5.txt

…

simple_line.txt

…

simple_lines_both.txt

…

simple_lines_interleaved.txt

…

simple.xml

…

sort_out1.bed

…

sort_out2.bed

…

sort_out3.tab

…

sort_out4.sam

…

test.vcf

Add VCF_BGZIP to VCF converter

2020-07-25 01:33:02 +01:00

test.vcf.gz

…

testdir1.tar

…

testdir1.tar.gz

…

testdir1.zip

…

testdir.tar

…

tinywga.bed

…

tinywga.bim

…

tinywga.fam

…

tinywga.map

…

tinywga.ped

…

tinywga.ped.space_to_tab

…

unsafe_relative_symlink.tar

…

unsafe.tar

…

unsafe.zip

…